Alla chiusura delle operazioni di voto, il rilevamento dell'affluenza alle urne per la consultazione referendaria nelle 254 sezioni della città di Messina, ha fatto registrare una percentuale finale del 56,74 per cento, con 106.831 votanti.

In occasione dell'ultimo appuntamento referendario nazionale dello scorso 17 aprile, alla chiusura delle operazioni di voto, venne registrata una percentuale finale del 24,4 per cento, con 46.122 votanti. Il precedente appuntamento referendario del 12 e 13 giugno 2011, quando si votò su due giorni, alla chiusura dei seggi dopo la prima giornata di votazione venne rilevata a Messina una percentuale del 33,88 per cento del corpo elettorale, mentre la percentuale finale fu del 47,98 per cento con un numero di votanti differente per ogni singolo quesito referendario. Nel giugno del 2009, dopo la prima giornata di votazione, la percentuale fu del 7,52 per cento del corpo elettorale e dell'11,76 per cento quella finale del giorno successivo, sempre con un numero di votanti differente per ogni singolo quesito referendario. Per i due precedenti referendum costituzionali bisogna risalire al giugno 2006 (percentuale finale alla chiusura dei seggi su due giorni di votazione) 42,05 per cento, pari a 83.187 elettori, e all'ottobre 2001, alla chiusura dei seggi nell'unico giorno di votazione si recarono alle urne 53.529 elettori, pari al 25,95 per cento.